秦九韶用了几天时间，找齐了他宠爱的几个美妾，雇马车装上了他的随身行李，跟随沈飞和黄药师两人一路到了岘山书院，沈飞大摆宴席庆贺了他的到来。还投其所好，由秦九韶自己设计建筑结构，在书院旁边建了个宅子作为他的住所，和黄药师的住处很近，方便两个人经常交流。
秦九韶今年四十岁，历史上只活了六十一岁。沈飞不想秦九韶这么早死，给了秦九韶一颗续命八丸。而且还劝秦九韶也习武，最起码可以大大延寿，也拿出了五宝花蜜酒说明了功效给秦九韶喝。书院里习武的风气很盛，虽然秦九韶年纪已经不轻了，不过按戚继光的观点，习武什么时候都不算晚。秦九韶是非常追求物质生活享受的人，这样的人也极惜命，几经劝说，就答应了。沈飞给秦九韶的武功配置也是亲传弟子标准的，秦九韶早年在四川领导过民兵武装，卷入参加过十一年对抗蒙古的战争，本来就擅长弓马剑术踢球，也是有一定武术基础的，相信以秦九韶的聪明才智，习武的进步速度也绝不会慢。
《数学九章》是秦九韶利用为母亲守丧的三年时间写成的。江晓原文中评价，如果秦九韶后来不是花费了那么多时间在追求物质享受和功名利禄上，也许还能在其他学术领域也取得数学上那样巨大的成就，这也是沈飞劝说秦九韶那段话的由来。把秦九韶聘请到书院去做学术研究工作，正好可以扬长避短，避免他再去浪费时间和搜刮百姓，或许在建筑、天文、音乐上也能写出几本《数学九章》水平的专著，取得比原先更大的成就，即便是数学上也未必不能再有完善。
数学家吴文俊对比发现中国古代数学代数强，欧洲古代数学几何强，其实是各有所长。《海岛算经》中有一题和《几何原本》一样，解法还更加简便。吴文俊甚至评价晚明的徐光启被利玛窦点歪了数学科技树，放弃了中国数学的强项。
不过中国古代数学有一个缺点，高等数学都是要用算筹进行演算，运算一道复杂的数学题算筹可能要摆满整个房间，到了明代工商业巨大进步，四则运算需求极大增加，算盘普及取代了算筹以后，不少原来用算筹演算的高等数学方法无法在算盘上复现，导致前代的很多数学专著没人看得懂而失传。
欧洲后来则是形成了一套阿拉伯数字和拉丁字母配合，不必用算筹算盘这些工具就可以进行纸面上运算高等数学的符号。就是在秦九韶的手稿中，也出现了类似符号化的数学表述，如果能完善下去，或许也可以总结出一套摆脱算筹和算盘的纸面运算高等数学的符号体系。这一点以后沈飞会提点引导秦九韶。
不过沈飞请秦九韶过来更大的原因是想让他参与改进武器装备，秦九韶“性极机巧，星象、音律、算术，以至营造等事，无不精究”，其中“营造”一项就可以用于武器的改进和研发。