两个月以后，沈飞进行了第一次总部搬迁，搬到了南京。原因自然是准备登基称帝建都，虽然有楚威王和秦始皇先后埋黄金镇压龙气的典故，后来有很多人因此想挖黄金发财，结果金子没挖到，反而泄了地气的传说，导致建都南京的政权都比较短命。
三国的吴、东晋，南朝宋、齐、梁、陈、太平天国、中华民国都是这样，只有明代经历了永乐迁都，可是沈飞却还是选择了定都南京，而且以后也不打算迁都。一是因为这个世界不存在什么“龙气、王气”之类的玄幻东西，二是因为明朝历史的惯性。
最重要的是第三点，因为从宋代开始精华地区已经从北方转移到了南方，从内陆转向了海洋。南京是有出海口的，完全符合要求。皇宫雏形的初步营建还需要两个月完成，消息已经散布开去，新朝国号为“明”，这让明教中人很受鼓舞，各项准备工件都在进行。
不过在这之前，还有一件事情要做，就是要清除掉“元遗”分子，去除历史后患。或者更加确切得说，是要清除金国入侵中原以来三百多年来华夷观念淡漠甚至颠倒，汉人的习惯性奴才心理。
沈飞看到过史料，金国在侵占中原以后，从天会四年（1126）开始就如后来的的满清一样实行“剃发易服”，多次下令占领区百姓“即归本朝，宜同风俗”、“削去头发，短巾左衽”，否则“即使犹怀旧国，当正典刑”、“禁民汉服及削发，不如式者死”。
《建炎以来纪年要录》记载了很多百姓因为穿汉服或者头发样式不符合金人规定而被杀害的例子，到南宋乾道年间（1170），宋使范成大出使金国时，他的著作笔记中记载见到北方过了淮河直到汴梁的百姓装束已经普遍没有了汉人特征。
金国实行“剃发易服”有一条还超过满清，那就是不只当时的人，甚至波及了古人的衣冠，淳熙年间，宋使陈益道经滹沱河畔光武庙，“见塑像左衽”，就连庆幸过“微管仲，吾其被发左衽矣“的孔子也没有幸免，开禧二年(1206)，岳珂跟随宋军北伐至涟水，见军学宣圣殿“像设皆左衽，相顾浩叹”。
这种现象经过朱元璋洪武年间大力整改以后还没有完全绝迹，永乐八年济南、宣德七年河南、正统十三年山西都有官员报告文庙圣贤塑像“左衽”，要求整改的记录。
蒙元时期的公服是右衽，这属于官员制服，与民族无关，除此之外在服饰上没有强制要求。不过元军南下时一些投降迎接的汉奸为了讨好蒙古人主动打扮地和蒙古人一样，后来的“南人”为了讨蒙古人欢心方便升官也普遍在生活习惯上效仿蒙古人。