终于，朱元璋平定了江南的各方势力。先称吴王，后登基为帝。马秀英成为了大明国母马皇后。
马皇后在后宫推行勤俭，经常召集后宫嫔妃做一些衣物，命太监带到宫外分发给穷苦百姓。后宫被她管理得井然有序。对待太监、宫女，她更是十分仁爱，从不苛责宫人。
此时的洪武帝拥有几百个漂亮的嫔妃。可没有一个女人妄想与马皇后争宠——因为她们知道，无人可以取代马皇后在洪武帝心中的位置。
马皇后居功而不自傲。洪武帝屡次想要赐予马皇后的娘家亲人官职，都被马皇后拒绝。她告诉洪武帝:“不要忘记汉末的外戚之乱。”
洪武帝喜怒无常，猜忌臣子。每次洪武帝想杀人，都是马皇后极力劝阻。朝中不知道有多少大臣被马皇后救过性命。
洪武帝从遥远的思绪中走出来。他生命中最重要的女人去了。他像一个孩子一样伏在马皇后的胸前，泣不成声。
忽然间，洪武帝听到殿外传来震天撼地的哭声。那是太监宫女们发自内心的哭喊。他们为失去了一个贤良淑德的后宫之主感到彻骨的悲伤。
洪武帝擦干了眼泪，对马皇后说:“秀英，你安心的去吧。朕会做一个称职的皇帝，给咱们的标儿留下一个铁桶一样的江山！”
马皇后凤驾西归的当日，洪武帝召见了礼部尚书刘仲质。
洪武帝给了刘仲质五道旨意:其一，自今日起至朕龙御归天止，有任何官员胆敢提议册立新后者，一律杀无赦。
在洪武帝看来，只有他的秀英配做他的皇后。
其二，就藩藩王立即返回应天，为先皇后守灵尽孝。
其三，朝中官员、公侯皆可入坤宁宫哭祭先皇后。
其四，应天城内外百姓，皆着素缟四十九日，为先皇后送行。
其五，祭奠过后，将先皇后遗体葬于孝陵，待朕百年后与先皇后合葬。
刘仲质领旨后提醒洪武帝:“应该及早为先皇后拟定谥号。礼部好赶制先皇后灵牌。”
洪武帝想了想，对刘仲质说:“孝、慈、高三个字，足矣评价先皇后的一生。”
刘仲质流泪叩首:“是，圣上。孝慈高皇后凤驾西归，礼部立即着手大祭事宜。”
明史对孝慈高马皇后另有一个中肯的八字评价:“母仪天下，慈德昭彰！”