炼制贤者之石的基础材料很简单，黑色物质和水银。黑色物质就是含有水分的潮湿物，这东西用日月皇家魂导师学院的日月湖内的淤泥就可以。而水银这种基础的金属也可以在店铺中买到。
在炼金术中，地球上的万物都由四大元素构成，它们是：火水风土。四大元素的理论起源于古希腊的巫师恩培多克勒。此外，恩培多克勒还将这四元素分为阴阳两对：火和风为阳，水与土为阴。在公元前4世纪，柏拉图又为四大元素加入了四种特质：热干湿冷。即火具有热和干，土具有干和冷，水具有冷和湿，风具有湿和热。
黑色物质具有水和土的效果，而水银则具有风的属性。最后在用500c～700c的火焰进行煅烧，这下四大元素就全都齐全了。
柯罗诺斯首先将淤泥与硫磺和水银融在一起，按照书中的比例6:3:1糅合在一起。柯罗诺斯将它们挨个放在天平上称重，最后将它们糅合成一个球状。
之所以需要用到硫磺。是因为单纯的将水银跟淤泥放在一起，是融合不进去的。而水银跟硫磺碰在一起会形成无毒的硫化汞。
然后就是放在火上煅烧了，五百摄氏度的火焰温度很好解决。一般正常燃烧下的火焰温度就能达到四百度左右，柯罗诺斯只需要制作一个稍微大一点的酒精灯就能解决这个问题。但是柯罗诺斯还是选择了利用魔法阵，虽然魂导器产生的火焰温度更加的恒久持稳，但毕竟魔法阵的产生的火焰自带的自然魔力，相对于贤者之石来说更加亲和一点。
柯罗诺斯直接将坩埚架在魔法阵上，然后将糅合好的原料放进了坩埚之中。
不一会儿坩埚中飘出一股烟雾，柯罗诺斯挠了挠头。尼克勒梅的笔记上好像并没有记载煅烧的过程中会怎么办，所以柯罗诺斯也不知道这是不是正常现象。他现在所能做的就是耐心等待了。
大概过了三十分钟左右，坩埚内淤泥和水银的柔和物分解出了的美妙云雾已经上升到了寝室的顶部，此时坩埚中充满烟雾，柯罗诺斯已经看不清坩埚内的情形了。慢慢的混合物中分离出来的气雾逐渐开始下降还原，柯罗诺斯低下头去看坩埚里面。发现和混合物在玻璃瓶中升腾。浓汁已经慢慢凝结，变得更黑更浓稠，有点想沥青，完美的腐化作用使他闻起来就像埋葬着腐物的墓穴，如同尸体在坟墓中自然腐烂发酵的气味。
这第一步应该算是完成了吧！柯罗诺斯看着坩埚里面的黑乎乎的物体。炼制贤者之石工作的第一部分，即在糅合物彻底地物质溶解腐化之前的状态，也被叫做黑化。
估计当初自己的魔药课老师斯拉格霍恩教授怎么也不会想到柯罗诺斯有一天会用坩埚煮泥巴吧！柯罗诺斯带上手套无奈的将手伸进了那坨黑乎乎粘稠的物质，他还真的在这里面摸到一块不大不小的硬物质，柯罗诺斯将它拿了出来浸泡在生命之乳中，其实就是羊奶里面。并在里面又加入了等量的水银。
接下来就又是漫长的等待了，第二步的过程被叫做白化。这一步其实就是化学中的分离了，这没什么。尼克勒梅的笔记里说只要严格按照步骤去操作就可以达成目标。果不其然，慢慢的清洗后的黑色物质开始与水银又一次重合，柯罗诺斯发现它真的就像笔记上写的那样原本黑色的外围包裹物开始逐渐褪去，漏出里面乳白色的表面。第三步，也是炼制魔法石最难的一步。柯罗诺斯需要将刚刚被白化下来的黑色物质重新放入坩埚内，用一千摄氏度的火焰再次煅烧将其重新组合在一起，这个也被叫做黄化。尼克勒梅笔记上给出的评价是，这是最关键的阶段，在成功之前，你在操作中每一步都有可能犯下知名的错误。一旦你在这一阶段取得成功，你就在也不用担心失败了，除非你不小心打破了瓶子。