这些部门都划到了国民军事委员会名下，国民军事委员会最高长官为委员长，设立常委会（成员人）负责国民政府辖区内的一切军事事务，而委员会每五年选举一次常委会成员（理论上），常委人，委员十八人到二十七人不等，超出为候补。
军事委员会下设总参谋部，负责军队事务的具体执行，包括海军部，军备部，国民武装动员部，军情局，军队法务部五个大部和若干个局。
军队团以上建制的更变、军官的任免均有军事委员会直接管理，所有的军官都严禁自行提拔和任命，军队的基层军官都必须由军校培训后派出，营以上军官每三年对调一次，新兵，武器弹药，军需军饷均有总参谋部统一管理发放，，。
按照这个方案來执行，那么最终的结果就是王振宇通过军队牢牢掌握了一切，反过來如果不是他王振宇了，别人就别想通过军队做什么。
方案一问世，无论是革命党还是国社党内部的争议都很大。
在王振宇集团内部，反对的声音首先出现了，因为从目前的形势來看，国社党明显处于优势，谈什么谈，直接打不是更好的观念在党内很有市场。
而第一个跳出來反对的自然就是王振宇的亲信将领们，他们不理解为什么要合并，而合并之后如何保卫自己的胜利果实，王振宇对此很理解，毕竟大家把脑袋别在裤腰带上干了四个月的仗，好不容易夺了七个省的地盘，结果现在却要和人合并共享，换谁心里也不舒服。
王振宇也不担心，他在第一天会议之后，在杜公馆单独请徐源泉等七名高级将领喝茶。
“和则两利，分则两败，在座各位都是从玉带门一路跟随我过來的，这么多年來，你们自己想想，我可曾让大家吃过亏。”
徐源泉等人想想，摇头表示沒有。
王振宇笑道：“那么在这个时候大家就应该团结在我的麾下，帮着我为实现南方省统一努力了，请相信这一次，我们同样不会吃亏。”
而在华革命党内，质疑的声音同样存在，刚刚从法国归国的汪精卫甚至公开声称这是在与虎谋皮，最终的结果是导致本党被吞噬，胡汉民对汪精卫的观点也十分认可，他甚至想联合张静江、廖仲恺等人一起再劝劝孙山，但是张静江此刻已经在忙着看王振宇国社党这边提出的底案，他觉得很不错，可以一试，所以根本不掺合胡汉民的烂事，廖仲恺则是大事小事唯孙山马首是瞻的，自然也不可能听胡汉民的。
而陈炯明也是支持合并的，他甚至对胡汉民道：“如果按照这个方案來，那地方上是就等于是联省自治了，我们等于走上了美国的道路，有什么不好，为什么要反对，难道你胡展堂还恋着手里的权力不放。”
胡汉民气得要死：“你陈竞存脑子坏了，如果按照这个方案，我们的党军就的交出去，沒有军队，如果他王振宇要是第二个袁世凯怎么办，我们拿什么对付他，约法吗。”
陈炯明毫不在意的摇摇头道：“那现在靠我们手上连李厚基都啃不动的十万大军就能对付王振宇那三十万虎狼之师了，谈判的目地就是要避免流血，结果你胡展堂居然还想着流血的事情，难怪这个事情会难办，你啊就知道眼前那点小利，不为咱们国家想想。”
陈炯明和胡汉民从辛亥革命那会起就因为广东都督的位置而看彼此不顺眼了，所以说话自然是怎么气人就怎么说了，坐在一边的许崇智见两人要吵翻了，连忙出來劝和道：“我说这还沒开始谈，自家兄弟就不要闹了。”
陈炯明对许崇智还是很客气的，所以哼了一声不说话了，许崇智乃对胡汉民道：“展堂啊，竞存的话也不是沒道理，你是不知道军的实情啊，别看咱们手里号称有十万大军，那跟人青年军不一样，人家是实打实的，有一个兵就一个兵，咱们十万人起码有三四万的空额，而且论起战斗力來，也就是竞存的粤军万把人和侠如（李烈钧）的赣军二万人能打，而青年军那可是刚刚一口气歼灭了十几万北洋军的虎狼之师，别说是我们，现在谁不敬畏三分啊，最关键的还是那帮子宁波商人靠不住啊，咱们进浙江的时候说的好，现在到了杭州外，发不出军饷了又见不到了，沒钱沒装备，我们拿什么跟人王振宇斗啊。”
胡汉民听到这里，仰天长叹道：“怎么又走到辛亥革命哪一步呢，要是英士还活着就好了。”