对于装甲坚厚的战列舰来说，鱼雷的威胁永远都比炮弹和炸弹更大，因此水下的装甲带也成为兴登堡级战列舰唯一没有在厚度上遭到太大削减的装甲，甚至连原本受到忽视的船底也被加上了厚度不逊于水线的装甲，以防备定深较大的磁引信鱼雷或者同样引信的水雷攻击船底。要知道在船底爆炸的话，只要威力足够，产生的冲击波会直接破坏龙骨，如果没有装甲保护或者装甲厚度不够，甚至会一下子就让军舰断成两截，排水量再大也不会有什么区别
此外，兴登堡级战列舰舰体后部的形态胡卫东参考了历史上的依阿华级战列舰（其实大和级也是这样），比传统的欧洲战列舰“肿”得多，因而可以加装较多的水密隔舱，使得原本薄弱的舵尾也具有了相当强大的防雷能力。
甚至可以这么说，除非连续两枚鱼雷命中的位置十分接近，否则哪怕是史上威力最大的93式3型氧气鱼雷，也未必能够击破兴登堡级战列舰的水下装甲。而即便是侥幸地出现这种情况，兴登堡级战列舰众多的水密隔舱依然可以保证其安然无恙，只要舰员损管时不犯低级失误，这款超级战列舰简直是不可能被击沉的
当然，如果敌人的攻击次数太过频繁，装甲的性能将会不可避免地迅速下降，那么再强的防护能力也终有顶不住的时候。但是由于兴登堡级战列舰在海面上无可比拟的统治力，真正能够威胁到它的也只有水下的潜艇和天上的飞机了，因此兴登堡级的反潜与防空能力也都受到了极大的重视
其中前者在设计上要做的工作很简单，加装最先进的声纳以及多层次的反潜深弹发射器（刺猬炮【刺猬弹发射器】对付较近距离的，火箭深弹发射器对付较远距离的。）就行了。但严格来说，对于大型军舰来说，如果有反潜舰艇随行。潜艇很难直接攻击到它，而如果落单的时候遇到潜艇，那么首先要做的不是反潜。而是立即撤退，造价差太多了，一艘换十艘都亏死了，白痴才冒险和潜艇交战呢。
即便真的不小心遭到潜艇偷袭。对于防护能力空前强大的兴登堡级战列舰来说也很难构成致命的威胁，因为现在的一艘潜艇最多也就6根鱼雷发射管，哪怕一轮全部命中都很难将其击沉（除非是93式3型氧气鱼雷。但以氧气鱼雷那悲催的可靠性，别说命中了，能有一半自己不出问题就要谢天谢地了），何况实战中哪怕能中一发都算幸运。更重要的是，这个年代的潜艇航速远远不如战列舰，水下航速更是慢如蜗牛，兴登堡级战列舰只要舰员没有犯浑。肯定不会再给潜艇发射第二轮鱼雷的机会