尽管三好长庆已经将家中大小事务都交给三好长逸、三好政康、岩成友通、松永久秀等人去商议后处置，但对三好义兴的葬礼却是亲自负责，甚至到了每一个环节都要过问的地步。
面对伊势北畠家送来的三好义兴之首级，三好长庆在亲自确认之后，就命人立即将其与尸身进行缝合，而后葬于摄津芥川山城附近的灵松寺（曹洞宗寺院，山号黄牛山）之中，戒名为瑞应院光岳琏公大禅定门。同时，他还请来了近畿诸国之中，以大林宗套、日珖、笑岭宗䜣等人为首的上百名高僧为三好义兴做法事祈福。
不仅如此，三好家上下，不单单是三好家的一门亲族众、谱代家臣纷纷前往灵松寺去参加三好义兴的葬礼，就连远在阿波、讃岐、淡路、东伊予等地的三好家旗下国人领主们大都前来参加。
可以说，三好义兴是整个三好家中最为理想，也是实至名归的继承人，他自从元服以后就一直跟随在三好长庆的身边。平时谦恭待人，和家臣、豪商、僧侣、公卿之间都有着良好的关系，见识过腥风血雨且处变不惊，有着丰富的处理政事的经验。
故而，三好义兴年纪轻轻便赢得了整个三好家上下，以及朝廷、足利将军家、近畿诸国各寺院神社、堺町豪商们等各方各派的一片好感。
只可惜造化弄人，白发人送黑发人。
三好义兴的突然离世，险些逼疯了三好长庆。他无助得就像一个孩子，只能不停的用眼泪表达自己此时此刻的心情。
可摆在三好长庆面前的还有一个十分严峻的问题，他之后该选谁来接手三好家的基业？
经过苦思冥想后，三好长庆最终选择了侄子，同时也是自己养子的三好熊王丸，而非嫡孙三好孙次郎丸。
而后，三好长庆就指认三好长逸、三好政康、岩成友通三名家中重臣作为三好熊王丸的后见役、傅役进行辅佐。而还在襁褓之中的嫡孙三好孙次郎丸，则是由三好义兴马廻众出身的横田内膳负责抚养。
至于三好实休、野口冬长二人的无头尸身，三好长庆则是将他们安葬在和泉堺町之中的妙国寺之中。
之所以三好长庆没有将三好实休、野口冬长二人与三好实休葬在一块儿，是因为妙国寺的开基之人就是三好实休。
为了避免三好义兴的死引起连锁反应，以及尽快让近畿诸国的局势稳定下来，三好长庆还亲自做主，将叛臣久米义广的未亡人（前任阿波守护细川持隆之妹）改嫁现任播磨、备前两国守护赤松晴政，意图以此来拉近三好家与旗下大名赤松家之间的关系。
然而，三好长庆并没有意识到，他这个决断反而导致赤松家发生了内讧。
因为，赤松晴政长男赤松义祐的正室是细川晴元之女。
只要赤松晴政迎娶了久米义广的未亡人为正室，那么赤松义祐将不再是赤松晴政的嫡长子，反而成了庶长子。将来赤松家极有可能会在三好家的介入下，使得赤松义祐会无法顺利继承赤松家的家名。
故而，赤松义祐极为反对其父迎娶久米义广的未亡人为正室。