虽说此次能登方面的地震对于上杉家治下的佐渡、越后两国并没有造成什么太大的影响，但越中方面就不一样了。
首先就是射水郡、新川郡两郡的沿海地区。因能登的地震波及影响，引发大约一间（大约1.9米）高的海啸发生，导致射水郡、新川郡两郡的沿海地区受到了较为严重的损害。
海啸不仅冲毁了不少农田、屋舍，甚至连地势较低的地区都能浮起船只。
时任越中守护代柿崎景家不得不暂缓对作乱的神保氏纯、铃木国重二人的征讨，转而对守山城、太田本乡城两地进行围困，并开始着手统计因海啸发生的伤亡情况，以及各地受损情况。
而能登方面的受损其实比越中方面还要大，还要严重。尤其是位于能登北部的珠洲郡、凤至郡两郡。
因地震强度较大，甚至引发了近三间高的海啸。
珠洲郡、凤至郡两郡在地震、海啸过后可谓是一片汪洋。屋舍被毁达到三千一百间以上，两郡的农田几乎全毁，遇难人数达到三百人以上，人员受伤更是高达三千余人，流离失所者达两万人以上。
再加上能登四郡全境之中的重要道路、桥梁不是被地震震坏，就是被海啸冲毁。
而且，受损最为严重的还是匠作畠山家权臣长续连、平总知、三宅总广等人的领地，以及温井家的旧领。
如此一来，长续连、平总知、游佐宗円、三宅总广、温井续宗等人因领内愁苦、农田被毁、钱粮困乏、士卒疲惫等诸多不利困境，不得不对七尾城解除围城，并派遣使者与游佐续光、饭川义宗等畠山义续麾下重臣进行接触，希望双方能因此达成暂时停战。
其实，畠山义续也不想继续打下去。因为匠作畠山家本就没有多少本钱可以供自己挥霍，加上为七尾城输送粮草辎重的东新川众也向自己说明了越中一国同样遭到地震、海啸的灾害后，就打算先给长续连、平总知、游佐宗円、三宅总广、温井续宗等人一个台阶下，让他们各自撤兵返回本领。
这样的话，其实对匠作畠山家来说也有一定的好处。因长续连、平总知、游佐宗円、三宅总广、温井续宗等人是向匠作畠山家举起的反旗，在面对如此天灾之后，畠山义续就可以不用出一文钱对他们进行救助，更不用接济来自珠洲郡、凤至郡两郡的难民。
毕竟，畠山义续可不认为长续连、平总知、游佐宗円、三宅总广、温井续宗等人会放弃与自己争权的想法，他还需要趁此机会继续对本据七尾城进行加固、扩建，以及囤积更多的粮草，以防长续连、平总知、游佐宗円、三宅总广、温井续宗等人再度袭来。
与此同时，上杉清定可没有对越中一国的受灾情况不闻不问。
清定在接到柿崎景家的汇报后，当即下令由须田村定节制北方满繁、梅津真茂、谷塚高纳、土屋照邦、新穂和泉守、羽黑真经、加茂真清、歌代真正等佐渡众诸将，以一千五百余军势火速经海路前往越中射水郡，一面进行救灾，一面协助内山满久、小浦光康（三善光康）、岛垣隼人佑等将继续围困守山城的神保氏纯。
同时，清定还下令平田宗定率一千余军势经海路进驻鱼津城，加强对富山湾周边海域的警戒。
不仅如此，清定更是大手一挥，免除了越中新川郡、射水郡、妇负郡三郡的年贡赋税、劳役三年，以加快灾后的重建工作。