虽说浙江巡按御史之前是胡宗宪的兼职，但继任者王本固可与胡宗宪非亲非故，且过度的是非分明和耿直。他诱捕王直的逻辑非常简单——既然是倭寇首脑，就应该将其擒拿归案、邀功请赏。
就算胡宗宪嘴皮子都磨破了，依然没能说服王本固。
王本固非但没有释放王直的想法，甚至还倒打一耙，上奏朝廷，控诉胡宗宪袒护倭寇首脑王直，极有可能收受倭寇的贿赂。
终究胡宗宪是严嵩、严世蕃父子一派之人，朝廷之中与之对立的大臣们纷纷慷慨陈词，认为胡宗宪滥课军需，还公开袒护倭寇首脑，极有可能暗中与倭寇勾结。
一时之间，大明朝廷上大有将胡宗宪下狱的趋势。
为了不与王直当狱友，且不愿身败名裂，胡宗宪最终还是向现实低了头。他不仅在后续的奏章中修正了意见，并表态同意处斩王直。同时，他还不忘搭救下狱的下属蒋洲，为其辩解。
经胡宗宪与郎中唐顺之等部分交好的大臣疏救后，蒋洲功过相抵而获释。他出狱后茫然自伤，就算尚书谭纶驻节蓟辽，以参赞军务相招，也没能说服其重新为大明效力：“洲本书生，万里航海唯欲为国家树尺寸之效，功成谤兴，屈捐命之功，比赎罪之例，洲复何望。”
最终，蒋洲以白身的身份病卒于河北昌平旅舍。
而王直则是于嘉靖三十八年（扶桑永禄二年）十二月二十五日，被斩首于浙江省杭州府官巷口，临刑前见儿子王澄最后一面。父子抱持而泣，王直拿一根髻金簪授王澄叹曰：“不意典刑兹土！杀我一人无碍，只是苦了两浙百姓，我死之后，此地必大乱十年！”
随后，王直伸颈受刃，至死不挠。
正所谓鸟之将死其鸣也哀，人之将死其言也善。
王直所言不虚，没了他的约束，倭寇确实愈发猖獗。
胡宗宪倒是因诱骗倭寇首脑王直至浙江杭州，并协助擒拿之功，被朱厚熜授予太子太保的荣誉官职。
尽管王直的死讯已经传至舟山群岛，但出人意料的是，随王直前来大明的部众以及大友家和松浦家朝贡船队并没有作鸟兽散，反而在王直养子王滶率领下据山而守。
王滶在获知养父王直被捕的消息后，第一时间杀害了胡宗宪派来的人质夏正，并将其肢解。
起初，胡宗宪以为自己派遣俞大猷、戚继光等将统辖上万兵马前去讨伐，必然攻无不克、战无不胜，还能一举剿灭王滶这个走投无路的倭寇余孽。
然而，胡宗宪还是低估了王滶。
明军的攻势从春天开始，一直打到了夏天。
风景变了，天气变了，每天的战报却从未改变。