这个病的病因既然是先天性的，要从房间隔是如何长出来讲起。
房间隔这面墙在砌的过程中，需要先砌一面初始墙，名字叫原发隔。原发隔砌完的过程中如果发生异常缺块，留出来的空隙叫做原发孔。原发孔一直填不上，叫做原发孔房间隔缺损了。这是房间隔缺损的其中一类病。
按照上述的说法，原发膈是需要砌完整的，这样不会发病了。问题在于，房间隔砌墙过程是宝宝在妈妈的子宫里属于胎儿时期砌起来的。
胎儿时期砌墙有个大毛病：胎儿时期宝宝汲取的氧等营养是通过胎盘，不是通过自己呼吸肺循环得到。因此胎儿的右心房和左心房需要相通，让胎盘里富含血氧等营养的血液能直接流入到宝宝的左心房左心室，继而去到整个体循环营养全身。
这样一说，房间隔砌墙是不能把整面墙堵死的，要怎么办？
只好在砌出来的原始墙退化出个孔，这个孔是后面长出来的，所以叫做继发孔。
继发孔在胎儿期对宝宝有用，孩子出生后是没用的，而且继续留着要出问题的。人体为此提前做好了堵孔的准备，于是在原始墙上长出另一面墙叫做继发膈，这个继发膈相当于堵孔的补丁片。此时继发孔有了另一个名字，这个名字不少宝妈听过了：是赫赫有名的卵圆孔。
总结起来一句，胎儿时期为了保持左心房右心房相通，继发膈和原发膈是不融合的。这样血液可以进入右心房的卵圆孔，再通过原发膈和继发膈的间隙来到左心房。