小智他们继续朝着圆朱市为目标，来到了一处岩石遍布的峡谷，峡谷的尽头有一座建筑物，这里正是阿露夫遗迹
“那是什么骨头啊？”，走进了阿露夫遗迹后，小霞指着岩壁上的一处问道
“看上去有点像化石翼龙啊”，小智看了看后说
“你这么一说，还真是呢”，小霞和小刚仔细看了一下后又说
“说起来，不知道我的化石翼龙过的怎么样，还有其他一些没呆在身上的宝可梦过的怎么样呢”，小智想起了自己的化石翼龙碎碎念道
“你的化石翼龙过的很不错呢，最近好像又实力增进了不少”，，这个时候，小智背后传来了声音
“大木博士?”，小智他们转过头，才发现原来是老熟人大木博士
“哦，好久不见了”，大木博士打了招呼
“好久不见，对了，博士，你到这里有什么事情吗？”，小霞突然问
“是我的学生邀请我来，说是有很大的发现，你们和我一起去看一下吧”，大木博士说完后还邀请了小智他们一起去，小智刚好也有兴趣而且想要知道自己其他宝可梦的近况
在一起去的路上，小智得知了大家都在用自己适合的方法进行着特训，而妙蛙草在小智旅行的时候，解决了研究所中的水系神奇宝贝与草系神奇宝贝的纷争问题，所以现在相当于管理者，而卡咪龟则是协助妙蛙种子平等地位的协力者，相当于两位大王吧。比雕也经常会去操练一下真新镇外面森林里的比比鸟和波波们之后，来回飞行，增强他们的执行力之类，现在都已经可以有些不错的配合了，而快龙则在陪着其他宝可梦一起玩或者特训之类的
“啊，大家都很努力呢”，小智走在路上感叹道
“大木博士，太好了，你终于来了”，此时已经走到了峡谷尽头的屋子中，然后看着一位刺猬头叔叔高兴的迎接着大木博士
“好久不见了啊，佐竹同学，给你们介绍一下，这是在彩虹大学选修我课程的佐竹同学”，大木博士回应了之后又对小智他们介绍自己学生的名字
“博士，他们是？”，佐竹看着小智他们问
“他们分别是我们真新镇出发的小智以及他的同伴小霞和小刚，你说有大发现，我就把他们都带来了”，大木博士解说道
“大木博士，过来一下”，而佐竹则是把大木博士拉到一旁，偷偷说，看来是想要尽量保密这个大发现啊，“这件事如果发表出去的话，会引起颠覆学术界的大风暴，所以我才找博士秘密商量的”
“没事的，让他们拓展见闻也是成为宝可梦大师重要的一步啊，而且小智曾经也为我们这些研究者提供了一些材料啊，比如说凤王的照片，本已灭绝的化石宝可梦化石翼龙，稀少种的龙系神奇宝贝迷你龙哈克龙，闪光神奇宝贝的猫头夜鹰，还有特殊的耿鬼”
“什么？化石宝可梦！好吧，这次就破例吧”，听到了其中的化石宝可梦后，佐竹又让小智他们参与了进来
“那是在干什么？”，小刚发现一位工作人员拿着一个喷水装置冲洗骨头
“他正在用水冲洗化石上的泥土和不纯物质，那些用刷子是刷不掉的”，佐竹解释道，“哎，最近水源一直不稳”，突然发现一起拿有一会不出水，佐竹抱怨道
“水源是哪里？”，大木博士问
“是在后面森林深处，那里有丰富的地下水”
“佐竹研究的是神奇宝贝古代史”，大家一边参观这个研究所，大木博士同时还担任解说