让即将失控的一支军队，重新稳定下来之后，邓继祖下令全军立即朝京都出发。
江户城已经彻底的毁了，除开还有着城墙，城内的所有建筑都已经毁的没有几座完好的了。城内尸横遍野，有些街道甚至无处下脚。
惨烈的一幕，仿若人间地狱。秦军没有心思去收拾尸体，幸存下来的江户城百姓，只有先前就逃出去的人，秦军离开，他们折返，看到城中的如此景象，一个个疯狂的大叫着离开了，再也没有回到过江户。
江户城几乎成了鬼城，在秦军走后几天，大量的野兽进入城中撕扯尸体，天空上食肉鸟类也在江户城上空盘旋，遮天蔽日，十分骇人。
还有活人幸存的江户城，面对蜂拥而来享受美食的野兽，再也无法待下去了，纷纷跑出城。
江户城彻底的没有了人类，有的活物只有着野兽。
这座城也终于彻底的变成了一座鬼城，在此后的几十年，这座城市都是处于一个废弃的状态，只有许多的流浪的武士才有胆子在城里的废墟中宿居一夜。
秦军在江户城的港口登陆后，船只远离港口，东海水师又将港口一番轰炸，炸毁了港口。然后东海水师的舰队沿着海岸线而后，先后攻克川崎、横滨以及横须贺市，江户湾沿岸大城具都被攻克，城中守军被杀戮或逃散，而对于百姓，则是秋毫无犯。这暂且的压制，只能让这支军队暂时性的不在具有强大的破坏力，不过时间久了，恐怕就要压制不住了。
郑成功的一百多艘舰队先行前往长崎，在哪里他将会和他的兄弟以及叔父一起攻略长崎所在的九州岛等各城。
另外邓继祖写了书信送往南京，请求援军，日本国土狭长，岛屿众多，若是想要彻底的占领，需要很多的兵力。
大秦军队的攻入日本，消息很快就传达到了各个城市，不过江户城的沦陷，幕府将军的战死，让许多城池的城主开始蠢蠢欲动，日本似乎又有回到那个战火纷飞的战国时代的样子。
邓继祖可不管这些，江户城攻陷，德川家光身死之后，现在就是要拿下日本天皇，控制住天皇后，再进行下一步的动作。
半个月后，一路走走停停，攻略沿岸各城，几乎是势如破竹，没有碰到什么有效的抵抗。
不过由于时间长久了，各地组织起来的军队也开始集结，当知道大秦军队的目标是京都之后，各地勤王军队开始朝着京都集结。
“我打算在大阪登陆，大阪是大城，又与京都相隔不远，我们外来作战，需要一个根据地，这大阪城濒海，有港口，正合适不过了！”邓继祖对手下众将说道。
两日后，邓继祖大军在大阪登陆，虽然这里有军队抵抗，但是面对着穷凶极恶，而且装备精良的秦军根本不是对手，不过一个时辰，大阪城就宣告城破，无数的秦军蜂拥而入，在城中，让邓继祖出乎意料的遭到了民间力量的抵抗，让进入城中的秦军们在遭遇了不小的损伤。
这些民间的抵抗力量，比日本的正规军还要狡猾，让秦军受到的损伤居然比与正规军交战的损伤还要大！
约束住手底下的士兵后，邓继祖马上从城中的大名挑选出来了城主，然后又开仓放粮，并且出榜安抚人心。这座城市是一个根据地，必须要做好绥靖政策，不说让这些日本人箪食壶浆，起码也不能让他们在背后捅刀子。
先是斩杀了城中一些作恶多端的地主阶层，然后又当着百姓的面杀了一些平时游手好闲欺压百姓的无赖，又将城中的所有粮仓开放，免费发放给百姓，并且还免除了城中的所有赋税。
这才稍稍拉拢了一下民心，让百姓们不至于这么仇恨这些外国军队。
普通百姓虽然被拉拢了，但是城中的武士阶层就没有那么好拉拢了，依旧是不断的抵抗者秦军。
邓继祖一连杀了七天，杀了一拨又一拨来刺杀他的流浪武士，并且对城中的武士进行驱赶和抓捕，总算城里恢复了宁静。
百姓们也还是正常的生活着，虽然听说秦军把江户城给屠了，但是看到城里的明军居然秋毫无犯，这让他们也放下心来了。